El trasplante de intestino delgado se realiza en pacientes con intestino corto o enfermedades que afectan su función. Puede ser de donante vivo o cadavérico, con una media de espera de dos años. Aunque el rechazo sigue siendo un problema, las nuevas drogas inmunosupresoras han mejorado las tasas de supervivencia. El futuro del trasplante incluye técnicas de ingeniería de tejidos, como el cultivo de células intestinales y la bioimpresión 3D de tejido intestinal funcional.